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| REGLAMENTO DEL ÁULA DE CÓMPUTO |
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| PROPÓSITO DEL REGLAMENTO | |||||||
El presente reglamento establece los objetivos, infraestructura,
personal, actividades, y operación del Salón de Cómputo
del Instituto de Biología para el Posgrado en Ciencias Biológicas
de la UNAM. |
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| DEFINICIÓN Y OBJETIVOS. | |||||||
El Salón de Cómputo es el área creada dentro del
IBUNAM con el fin de apoyar a las actividades del Programa de Posgrado
en Ciencias Biológicas de la UNAM de la siguiente forma: |
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| RESPONSABLE Y PERSONAL | |||||||
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| INFRAESTRUCTURA Y SERVICIOS | |||||||
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El
horario de funcionamiento del salón es de lunes a viernes de 10:00
a 18:00. |
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| USUARIOS DEL SALÓN DE CÓMPUTO | |||||||
Dentro de las personas que pueden hacer uso del salón
de cómputo se contemplan a usuarios internos y usuarios externos. |
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| Usuarios internos: | |||||||
Son
los tutores y estudiantes que participan en el Programa de Posgrado en
Ciencias Biológicas de la UNAM. |
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| Usuarios externos: | |||||||
Se considera usuario externos a todos aquellos (académicos
o estudiantes) que no pertenezcan al Posgrado en Ciencias Biológicas,
pero que estén adscritos al Instituto de Biología o bien
profesores invitados. 1. Para disponer del equipo de cómputo el usuario externo deberá hacer su solicitud presentando su credencial del IBUNAM. 2. Debido a que el centro de cómputo fue creado para apoyar las actividades del Posgrado en Ciencias Biológicas, tendrán prioridad, para el uso del equipo, los usuarios internos sobre los externos, por lo que el préstamo de servicio dependerá de la disponibilidad de equipo. |
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| SISTEMA DE PAGO | |||||||
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| OBLIGACIONES Y PROHIBICIONES A LOS USUARIOS | |||||||
| Obligaciones: | |||||||
1. Cumplir con las disposiciones generales que en materia
de cómputo se dicten en el presente Reglamento. 2. Responsabilizarse del uso adecuado del equipo que le sea asignado, respetando el horario que se establezca para desocuparlo. 3. Es responsabilidad del profesor el comportamiento del grupo durante su clase en el Salón de Cómputo. 4. Con el fin de llevar un control, cada equipo contará con una bitácora, en la cual el usuario se registrará obligatoriamente antes de iniciar su sesión de trabajo. 5. Revisar que los discos que utilicen estén libres de virus. 6. Contribuir a preservar los inmuebles y mobiliario del Salón de Cómputo, sujetándose a los mecanismos de control, seguridad y vigilancia que se establezcan. 7. Guardar respeto y consideración a los demás usuarios y al personal del Salón. 8. Respetar el Sistema de Pago por uso del plotter y la impresora láser. 9. Utilizar únicamente el equipo asignado y en caso de mal funcionamiento del mismo, reportarlo al encargado. 10. Al término del tiempo de uso dejar encendido el equipo y notificarlo al encargado. |
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| Prohibiciones: | |||||||
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1. Utilizar las instalaciones con propósitos diferentes
a los de tipo académico. |
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| SUSPENSIÓN DE SERVICIO. | |||||||
| Cualquier falta al presente reglamento puede ser causa de suspención temporal o permanente del servicio. | |||||||
| SECUENCIADOR
AUTOMATICO DEL POSGRADO EN CIENCIAS BIOLOGICAS |
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| SECUENCIADOR AUTOMATICO DEL POSGRADO EN CIENCIAS BIOLOGICAS | |||||||
El
Posgrado en Ciencias Biológicas de la UNAM puso en servicio, a
partir del mes de octubre del año 2000 su secuenciador automático
de DNA, ABI Prism 310. Este secuenciador está dando servicio a
los investigadores, tutores y estudiantes del posgrado, así como
a solicitantes externos. |
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El
secuenciador se encuentra en el Instituto de Biología, junto al
Jardín Botánico, en el Laboratorio de Biología Molecular
de Ciudad Universitaria, UNAM, México, D.F. La persona encargada
de su manejo es la M. en C. Laura Márquez Valdelamar. |
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Este
secuenciador automático analiza DNA marcado con fluorescencia por
medio de una electroforesis capilar. Está conectado a una computadora
Mac G3, la cual tiene el software necesario para interpretar los resultados,
y los presenta como una secuencia escrita y como electroferograma. El
tiempo de corrida de cada muestra es de tres horas. De cada muestra puede
obtenerse una secuencia de 700 bases. Puede analizar cadenas sencillas,
dobles o productos de PCR. |
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| COMO ENTREGAR LAS MUESTRAS | |||||||
Será
responsabilidad del usuario extraer, amplificar, purificar y cuantificar
el DNA que desee secuenciar. Pueden solicitarse las técnicas y/o
asesoría en el mismo laboratorio. |
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Para
purificar los productos de PCR se recomienda el uso de: |
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Para
purificar plásmidos se recomienda: |
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EL
DNA AMPLIFICADO Y PURIFICADO DEBE ENTREGARSE CUANTIFICADO. Esto puede
hacerse con un fluorómetro o espectrofotómetro. NO SE ACEPTARAN
MUESTRAS NO CUANTIFICADAS. |
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El DNA debe entregarse en agua estéril destilada y desionizada en la siguiente concentración: |
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Productos
de PCR: |
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Plásmidos: |
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Las
cantidades de los productos anteriores son para una corrida, se recomienda
entregar el doble para prever imprevistos. |
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Los
oligonucleótidos entregar 6µl, mínimo, a una concentración
de 4pmol/µl |
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COMO
Y CUANDO SE ENTREGAN LOS RESULTADOS |
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Los resultados se entregarán en un tiempo promedio de una semana, lo cual puede variar de acuerdo a la demanda. Se puede enviar el resultado por correo electrónico (la secuencia escrita, la cual puede leerse directamente en Word de PC o en Mac), o se puede grabar en diskette zip o disco de 3.5” el cual deberá proporcionar el usuario. El electroferograma se entregará impreso. |
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En
el caso de contar con el programa Chromas (http://www.technelysium.com.au/chromas.html)
se puede enviar tanto el texto como el electroferograma e incluso pueden
editarse los resultados. Este programa es para computadora PC. |
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Para
computadora Mac el programa Sequence Navigator o Edit View (http://home.appliedbiosystems.com/support/software/),
con los cuales también pueden editarse los resultados y ver los
electroferogramas. |
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| COSTO | |||||||
| Posgrado
de Ciencias Biológicas *15 USdlls *3 USdlls si ya tiene el Big dye y está purificado |
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| Externos *25 USdlls |
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| *en moneda nacional el equivalente de la cantidad indicada en pesos mexicanos a la fecha de solicitud | |||||||
| COMO SOLICITAR EL SERVICIO | |||||||
Para
solicitar el servicio debe dirigirse con la técnica Laura Márquez
(lmarquez@ibiologia.unam.mx),
Laboratorio de Biología Molecular, Instituto de Biología
(junto al Jardín Botánico Exterior), donde entregará
el formato de solicitud junto con las muestras, ella les informará
sobre la demanda del servicio y les indicará la cantidad que deben
pagar, así como el día de entrega. El usuario deberá
firmar de recibido cuando pase por sus resultados, o si se envían
los resultados por correo deben mandar un mensaje diciendo que recibieron
sus resultados. |
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A
los alumnos del Posgrado de Ciencias Biológicas la solicitud la
debe de firmar su tutor. Es responsabilidad del usuario revisar el electroferograma
para verificar la secuencia. |
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LAS SECUENCIAS SE COBRAN INDEPENDIENTEMENTE DEL RESULTADO. EL ÉXITO DE CUALQUIER REACCIÓN DE SECUENCIA ES DIRECTAMENTE PROPORCIONAL A LA CALIDAD DEL ADN PROPORCIONADO. LOS USUARIOS DEBEN MENCIONAR EN LOS AGRADECIMIENTOS DE LAS PUBLICACIONES LA ASISTENCIA PROPORCIONADA POR LA TÉCNICA RESPONSABLE DEL SECUENCIADOR. |
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| ÁREA
DE ESTUDIANTES |
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REGLAMENTO |
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| TEMARIOS
Y CALENDARIOS DE MATERIAS |
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| CALENDARIO SISTEMÁTICA II | |||||||
| TEMARIO SISTEMÁTICA II | |||||||
| Invitación | |||||||
| Applied Evolution | |||||||
| Choosing species to study | |||||||
| Conservation Genetics | |||||||
| Directions in Evolutionary Biology | |||||||
| Ecological and evolutionary traps | |||||||
| Estimating Divergence and Times | |||||||
| Evolutionary Computation | |||||||
| Imbreeding Depression in Conservation Biology | |||||||
| Imbreeding Effects in Wild Populations | |||||||
| Phylogenies and Comunity Ecology | |||||||
| Population persistance in fragmented landscapes | |||||||
| The (super) Tree of Life | |||||||
| The Genetic Architecture of Quantitative Traits | |||||||
| The Inheritance of Genes in Mitochondria and Chloroplast | |||||||
| The limits to use the threatened species list | |||||||
| The Quality of the Fossil Record | |||||||
| The tree of the life is a Tree (more or less) | |||||||
| The biology of digital organism | |||||||
| Troubleshooting Molecular Phylogenetics Analyses | |||||||
| Urban Ecological Systems | |||||||