Servicio certificado de identificación molecular de especies zoológicas.

Recepción de muestras.
El interesado deberá enviar una solicitud vía correo electrónico, dirigida a la directora de la Institución, Dra. Susana Magallón Puebla, al correo dibunam@ib.unam.mx. Las muestras se recibirán en el Laboratorio de Biología Molecular de Zoología del IB. El método de preservación y la forma de entrega de las muestras dependerá del grupo animal al que pertenezcan y a la naturaleza de éstas (consultar el formato LNB-LMBZ-FP01-04).

Resultados.
Los resultados del análisis son opiniones técnicas entregadas en forma de reporte final, en el cual se indica con claridad las condiciones de la muestra o muestras examinadas. Los resultados se entregarán en un máximo de 15 días hábiles.

Costo: $3,159.00 pesos por muestra (incluye IVA).

Servicio de Secuenciación.

Recepción de muestras (De click aquí para descargar el formato de solicitud de servicio)
Las muestras se reciben ya amplificadas y de preferencia purificadas. También se reciben muestras listas para su corrimiento en el equipo (después de la reacción de secuencia y purificadas).

Será responsabilidad del usuario extraer, amplificar, purificar y cuantificar el ADN que desee secuenciar. Pueden solicitar asesoría en el laboratorio, en caso de ser necesario.
Para la purificación de productos amplificados se recomienda el uso de Exo Sap (USB), kits de purificación de Qiagen, Amicon, Bio Basic o Promega. Para la purificación de plásmidos se pueden utilizar los kits de Qiagen o precipitación con PEG.

La calidad del ADN es uno de los puntos más críticos de la secuenciación automática. El templado debe estar en la concentración correcta, libre de contaminantes y disuelto en agua bidestilada estéril o con agua inyectable libre de pirógenos, y no debe estar degradado. El éxito de cualquier reacción de secuencia es directamente proporcional a la calidad del ADN proporcionado.

Los productos amplificados se debenentregar en la siguiente concentración, para una corrida:
Productos de PCR

De 100 a 1000pb entregar 100 ng (en concentración de 20 a 100 ng/µl)

De 1000 a 2000 pb entregar 200 ng (en concentración de 50 a 100 ng/µl)
Plásmidos

De cadena sencilla 400 ng (en concentración de 100 a 200 ng/µl)

De cadena doble 800 ng (en concentración de 100 a 200 ng/µl)

Los oligonucleótidos deben entregarse en una concentración de 10 picomol/µl; se requieren dos microlitros para cada muestra a secuenciar. Se proveen los siguientes oligos sin cargo extra: M13F, M13R, SP6 y T7.

Resultados.
Las secuencias resultantes se entregarán en un tiempo promedio de 10 días hábiles si la reacción se prepara en el laboratorio y en el caso de que se entreguen las muestras ya listas para su corrimiento en el equipo, se entregará en 5 días hábiles, lo cual puede variar de acuerdo a la demanda. El resultado se envía por correo electrónico.
El electroferograma de las secuencias puede visualizarse con el programa Chromas o con Sequence Scanner, ambos se pueden bajar gratis en la red. En el laboratorio hay una computadora con el programa Sequence Analysis v5.1.1 disponible para quien requiera utilizarla. Es responsabilidad del usuario revisar el electroferograma para verificar la secuencia.

Costos (en pesos, incluye IVA):

Servicio de Tipificación de fragmentos

Recepción de muestras.
Se reciben las placas con las muestras ya preparadas (con el marcador y la muestra), o bien, solo las muestras para prepar la placa en el laboratorio. Se debe especificar el fluoróforo con el que está marcada la o las muestras y la escalera a utilizar (ROX350, ROX500, LIZ500 o LIZ600).

Resultados. Los resultados de la tipificación de fragmentos se entregarán en un tiempo promedio de 10 días hábiles si la reacción se prepara en el laboratorio y en el caso de que se entreguen las muestras ya listas para su corrimiento en el equipo se entregará en 5 días hábiles, lo cual puede variar de acuerdo a la demanda. El resultado se envía por correo electrónico.

Los fragmentos se pueden visualizar con Genemarker. En el laboratorio hay una computadora disponible con el programa Genemapper v4.1.

Costos (en pesos, incluye IVA):

Servicio de Secuenciación masiva

Recepción de muestras. La muestra o muestras a procesar deben entregarse ya purificadas, libres de contaminantes, no degradadas y con buena calidad en una cantidad promedio de un microgramo.

Resultados. En el caso de la secuenciación masiva los resultados se entregarán en un periodo de 2 a 3 semanas. Se entregará un reporte con el número total de bases, número total de lecturas, el tamaño de longitud promedio de las lecturas y los archivos de la corrida en formato fastq y sff.

Costos (en pesos, incluye IVA) para solicitantes de cualquier entidad de la UNAM o externa.

Procedimiento para realizar el pago
Para poder realizar el pago es necesario solicitar la cotización a la encargada del laboratorio. Si el usuario es de la UNAM, se requiere que indique si el pago será con recursos de DGAPA, CONACYT, ingresos extraordinarios o recursos presupuestales. A los usuarios externos se les enviará su cotización y posteriormente su formato de pago con el cual deberán depositar la cantidad indicada. Una vez realizado el depósito favor de enviar copia del comprobante por correo electrónico a la encargada del laboratorio a la que le solicitó su cotización. En el caso de los servicios de secuenciación, tipificación de fragmentos o secuenciación masiva, enviar copia del mensaje al Lic. Mario Curiel: mcuriel@biomedicas.unam.mx

NOTA: Los servicios se cobrarán independientemente del resultado. Los usuarios deben mencionar en los agradecimientos de las publicaciones la asistencia proporcionada por la técnica responsable del servicio.

Servicio de Microscopía Electrónica de Barrido:

a) Comunicarse con el técnico del laboratorio, para solicitar una entrevista (teléfono: 55 5622 9089, email: berenit@ib.unam.mx).

b) En la entrevista, el técnico del laboratorio asesorará al usuario sobre la forma adecuada de preparar y entregar las muestras para su observación, así como para el llenado del FORMATO DE SOLICITUD DE SERVICIO (que deberá llevar la firma del tutor en el caso de los estudiantes).

c) Los usuarios deberán leer el REGLAMENTO DE USO DEL LABORATORIO y firmar la constancia de que no tienen dudas y están de acuerdo con los lineamientos del uso de los equipos y del laboratorio.

d) El día de entrega de las muestras (preparadas siguiendo las instrucciones del técnico), deberán entregar también el formato de solicitud de servicio debidamente requisitada. 

e) Una vez recibidas las muestras, se agenda una cita para montarlas para su observación. Una vez montadas, se calendariza la cita para el MEB.

Servicio de Microscopía Óptica:

a) Solicitar una cita con el responsable del LMF1 (teléfono: 55 5622 9089, email: berenit@ib.unam.mx).

b) El horario de servicio es de 8:00 a 17:00 hr de lunes a viernes. Si la demanda del equipo es alta, los usuarios podrán tener sesiones de de 2 hr, dos veces a la semana; si la demanda es baja, el usuario podrá hacer uso del equipo el tiempo que lo requiera dentro del horario de servicio.

El servicio de este laboratorio se ofrece en dos modalidades:

El usuario puede tomar sus propias fotografías, previa asesoría en el uso del equipo, y con supervisión y asistencia por parte de la responsable del laboratorio durante las sesiones (formato 1 para descargar).

El usuario puede llevar las muestras al laboratorio y dar las indicaciones sobre las estructuras y posiciones requeridas para que la responsable del laboratorio tome las fotografías (formato 2 para descargar).

Asesoría o capacitación a estudiantes y/o investigadores interesados en desarrollar protocolos o experimentos relacionados con técnicas de propagación in vitro.

Germinación y propagación in vitro de semillas de agave con fines de conservación como apoyo a productores.
 
Germinación y propagación in vitro de semillas de especies nativas de la región con importancia ecológica y/o económica con fines de conservación. El material debe ser de procedencia legal y perfectamente documentada.

Para solicitar informes, enviar un mensaje electrónico a cultivoinvitrounam@gmail.com para solicitar una entrevista.